根据《中华人民共和国知识产权海关保护条例》的规定，海关请求知识产权主管部门对侵权嫌疑货物的调查提供协助的，知识产权主管部门应当予以协助。由此可见，工商部门就你公司的货物出具的意见起的是协助海关调查的作用，有权对货物的知识产权状况进行认定的机关仍然是海关。
